Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX8Q9HC52 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms