Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBF2Q9HAK2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBF2Q9HAK2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms