Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG4Q9H9E3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG4Q9H9E3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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