Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C5orf42Q9H799 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C5orf42Q9H799 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms