Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RETREG1Q9H6L5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RETREG1Q9H6L5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RETREG1Q9H6L5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RETREG1Q9H6L5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RETREG1Q9H6L5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RETREG1Q9H6L5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RETREG1Q9H6L5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms