Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNMDQ9H2S6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms