Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD4Q9H223 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms