Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDCBP2Q9H190 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SDCBP2Q9H190 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDCBP2Q9H190 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms