Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP44Q9H0E7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP44Q9H0E7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms