Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA4Q9GZZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms