Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDGFDQ9GZP0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFDQ9GZP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms