Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHLHE41Q9C0J9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHE41Q9C0J9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHE41Q9C0J9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms