Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT23Q9C075 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT23Q9C075 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms