Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NLRP1Q9C000 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NLRP1Q9C000 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NLRP1Q9C000 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms