Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFIH1Q9BYX4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIH1Q9BYX4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms