Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSDMCQ9BYG8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GSDMCQ9BYG8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms