Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SYCP2Q9BX26 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYCP2Q9BX26 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SYCP2Q9BX26 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms