Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HIGD2AQ9BW72 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HIGD2AQ9BW72 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms