Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
DPCDQ9BVM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DPCDQ9BVM2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms