Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KATNB1Q9BVA0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KATNB1Q9BVA0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms