Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM208Q9BTX3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms