Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NDC1Q9BTX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms