Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PAGR1Q9BTK6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAGR1Q9BTK6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms