Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM2D3Q9BRN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms