Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP3Q9BQQ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP3Q9BQQ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms