Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BPIFA3Q9BQP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms