Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SGIP1Q9BQI5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGIP1Q9BQI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms