Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMSS1Q9BQ75 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMSS1Q9BQ75 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms