Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM7Q9BQ49 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM7Q9BQ49 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 645.6 ms