Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PKP2Q99959 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKP2Q99959 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms