Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RBBP8Q99708 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBBP8Q99708 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms