Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MEIS3Q99687 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms