Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RGPD5Q99666 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD5Q99666 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD5Q99666 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms