Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPS8Q99627 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS8Q99627 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPS8Q99627 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPS8Q99627 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPS8Q99627 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COPS8Q99627 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPS8Q99627 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPS8Q99627 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPS8Q99627 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPS8Q99627 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms