Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POP1Q99575 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POP1Q99575 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP1Q99575 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP1Q99575 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP1Q99575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP1Q99575 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POP1Q99575 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POP1Q99575 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POP1Q99575 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POP1Q99575 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POP1Q99575 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms