Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP88Q99567 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP88Q99567 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP88Q99567 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.5 ms