Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOTCH4Q99466 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NOTCH4Q99466 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms