Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

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Length 1,030 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMS19Q96T76 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMS19Q96T76 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
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