Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUFY1Q96T51 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms