Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF607Q96SK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF607Q96SK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms