Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms