Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCEEQ96PE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms