Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD11Q96NU1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD11Q96NU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms