Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM74Q96NL1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM74Q96NL1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms