Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf49Q96NF6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms