Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RILPQ96NA2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RILPQ96NA2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RILPQ96NA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RILPQ96NA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RILPQ96NA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms