Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KREMEN1Q96MU8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KREMEN1Q96MU8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms