Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf85Q96MD7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf85Q96MD7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms