Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EP400Q96L91 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EP400Q96L91 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms