Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHACTR3Q96KR7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHACTR3Q96KR7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHACTR3Q96KR7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms